Existen dos ediciones del programa. La edición Lite es gratuita e incorpora la mayoría de las funciones del programa. La edición Pro cuesta 25 dolares5 y añade varias funcionalidades avanzadas, como la posiblidad de incluir bibliotecas de enlace dinámico, gráficos 3D, partículas y funciones de dibujo avanzadas, entre otros. En la edición gratuita se muestra una pequeña imagen de Game Maker mientras el videojuego carga, mientras que en la edición pagada esta imagen es removida.
La compra se realiza desde un cuadro de registro en el mismo programa o desde el sitio web; el pago se hace mediante PayPal o tarjeta de crédito.