Command & Conquer: Generals dispone de tres facciones, posteriormente en Zero Hour estas se ven incrementadas con ejércitos especializados dirigidos por sus respectivos generales:

• Estados Unidos: el ejército estadounidense basa su superioridad bélica en unidades de infantería bien entrenadas y vehículos altamente sofisticados capaces de superar individualmente al enemigo, adicionalmente los estadounidenses disponen de la fuerza aérea más grande del juego, con aeronaves particularmente letales, como los Caza F-117 Stealth, F-22 Raptor y el Bombardero Supersónico Aurora, los generales de EE.UU. son el General de Fuerza Aérea, el General de Superarmas y el General de Armas Láser.

• China: China utiliza cantidades abrumadoras de unidades fuertemente motivadas para luchar y poderosos vehículos de guerra equipados con lanzallamas y proyectiles balísticos, el efecto combinado del número y los ataques chinos es capaz de generar tormentas de fuego terriblemente destructivas, adicionalmente el ejército popular cuenta con hackers que les permiten dar cobertura especial a sus fuerzas durante la lucha y saquear dinero a los enemigos, a través de un sistema de tecnología computacional, los generales de China son el General de Tanques, el General de Infantería y el General Nuclear.

• GLA: el GLA (en español Ejercito Global de Liberación y en inglés Global Liberation Army) utiliza tácticas de guerra asimétrica para conseguir sus objetivos, el engaño, el encubrimiento, las unidades suicidas y el uso de armas bioquímicas son recurrentes en esta facción, adicionalmente esta facción carece de fuerza aérea, obligando a los jugadores veteranos de Command & Conquer a replantear estrategias clásicas, los generales del GLA son el General de Demolición, el General Furtivo y el General de armas Bioquímicas.